中國高等航海教育發(fā)軔于
上海，1909年晚清郵傳部上海高等實業(yè)學堂（南洋公學）船政科開創(chuàng)了我國高等航海教育的先河。1912年成立吳淞商船學校，1933年更名為吳淞商船專科學校。1959年交通部在滬組建上海海運學院。2004年經(jīng)教育部批準更名為上海海事大學。為更好地服務上海國際航運中心建設和國家航運事業(yè)發(fā)展，根據(jù)上海市高校布局結構調整規(guī)劃，2008年上海海事大學主體搬遷臨港新城。2009年學校舉行百年校慶系列活動。
學校設有2個博士后科研流動站（交通運輸工程、電氣工程），2個一級學科博士點（交通運輸工程、管理科學工程），17個二級學科博士點，13個一級學科碩士學位授權點，57個二級學科碩士學位授權點，5個專業(yè)學位碩士授權點，45個本科專業(yè)，12個高職專業(yè)。擁有9個省部級重點研究基地?，F(xiàn)有1個國家重點（培育）學科，5個國家級特色專業(yè)，9個部市級重點學科，17個上海市本科教育高地。設有水上訓練中心，擁有萬噸級集裝箱教學實習船“育鋒”輪，新造世界最大4.8萬噸散貨教學實習船“育明”輪。
在2004年教育部本科教學工作水平評估和2006年教育部英語專業(yè)教學評估中獲得優(yōu)秀。2012年，年度科技總經(jīng)費達到2.8億元，獲一批國家級科研項目及部市級以上科技進步獎。
實行校院二級管理體制，現(xiàn)設有商船學院、交通運輸學院、經(jīng)濟管理學院、物流工程學院（設中荷機電工程學院）、法學院、信息工程學院、外國語學院、海洋環(huán)境與工程學院、文理學院（設徐悲鴻藝術學院）、科學研究院、海洋材料科學與工程研究院等二級辦學部門。在20000余名全日制學生中，有本科生17200余人，各類在校研究生2900余人。在1000余名專任教師中，有教授145名，具有博士學位的教師比例約45%。學校致力于培養(yǎng)國家航運業(yè)所需要的各級各類專門人才，已向全國港航企事業(yè)單位及政府部門輸送了6萬余名畢業(yè)生，被譽為“高級航運人才的搖籃”。
學校與境外50余所姐妹院校建立了校際交流與合作關系，開展教師交流、合作辦學、合作科研、學生交換等。與聯(lián)合國國際海事組織、波羅的海國際航運公會、挪威船級社等國際知名航運組織/機構建立了密切聯(lián)系。自2010年起開設“國際班”，邀請美國、韓國、波蘭、俄羅斯、德國等國家航海院校的學生來校學習“航海技術”、“航運管理”等專業(yè)。2011年，經(jīng)教育部批準，學校與加納中西非地區(qū)海事大學合作舉辦“物流管理”本科教育項目，并開始在非洲招生，這是上海市地方高校第一個頒發(fā)中國高校本科文憑的海外辦學項目。2012年，學校獲教育部批準正式成為“接受中國政府獎學金來華留學生院?！?。
